Enzim restriksi adalah enzim yang memotong DNA menjadi fragmen-fragmen di atau dekat situs pengenalan spesifik dalam molekul yang dikenal sebagai situs restriksi. Enzim restriksi adalah salah satu kelas dari kelompok enzim endonuklease yang lebih luas. Enzim restriksi umumnya diklasifikasikan menjadi lima jenis, yang berbeda dalam strukturnya dan apakah mereka memotong substrat DNA mereka di situs pengenalan mereka, atau jika situs pengenalan dan pembelahan terpisah satu sama lain. Untuk memotong DNA, semua enzim restriksi membuat dua sayatan, sekali melalui setiap tulang punggung gula-fosfat (yaitu setiap untai) dari heliks ganda DNA. Enzim ini ditemukan pada bakteri dan archaea dan menyediakan mekanisme pertahanan terhadap virus yang menyerang.
EcoRI: EcoRI (diucapkan “eco R one”) adalah enzim endonuklease restriksi yang diisolasi dari spesies E. coli . Bagian Eco dari nama enzim berasal dari spesies dari mana ia diisolasi, sedangkan R mewakili strain tertentu, dalam hal ini, RY13. Bagian terakhir dari namanya, I, menunjukkan bahwa itu adalah enzim pertama yang diisolasi dari strain ini. EcoRI adalah enzim restriksi yang memotong heliks ganda DNA menjadi fragmen di situs tertentu.
BamH I: BamH I yang diisolasi dari Bacillus amyloliquefaciens adalah endonuklease restriksi tipe II, yang memiliki kapasitas untuk mengenali sekuens pendek (6 bp) DNA dan secara khusus membelahnya di situs target. BamH I mengikat pada urutan pengenalan 5′-GGATCC-3′ dan memotong urutan ini tepat setelah 5′-guanin pada setiap untai. Pembelahan ini menghasilkan ujung lengket yang panjangnya 4 bp. Dalam bentuk tidak terikatnya, BamH I menampilkan lembar b pusat, yang berada di antara -heliks.
Soal: Apa itu enzim restriksi? Sebutkan dua enzim restriksi dan sumbernya